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“Desde 1972 la Sra. Margot Loyola se ha desempeñado como maestra de música y danza chilena de tradición oral en nuestra Universidad. En 1998 recibió el título de Profesor Emérito de nuestra Universidad. Y el año 2006 fue investida con el Grado de Doctora Honoris Causa. La Maestra Loyola es una destacada académica, desarrollando la docencia junto a múltiples actividades de estudio y recopilación, formando a cientos de profesores de música, intérpretes e investigadores”. Discurso del Rector de la PUCV Alfonso Muga Naredo en el Acto donde fuera investida con el Grado de Doctora Honoris Causa.

A fines de septiembre de 1994, Margot Loyola recibió el Premio Nacional de Arte, mención Música conquistando así una tierra incógnita para nuestra historia musical y cultural. Musical, porque nunca antes se había otorgado este galardón a una mujer, y cultural, porque tampoco antes se le había reconocido al arte popular tan alto sitial.

A lo largo de su vida ha sido distinguida con más de mil premios y reconocimientos y nombrada Hija Ilustre de muchas ciudades y pueblos de Chile, Valparaíso y Linares entre muchos. Destacan el "PREMIO APES" en 1990, otorgado por la Asociación de Periodista de Espectáculos de Chile como la mejor intérprete en el género folklórico.

En 1996 recibe la Orden al Mérito Docente y Cultural “Gabriela Mistral”, en el Grado de Gran Oficial, siendo el reconocimiento más alto que se otorga a personalidades nacionales y extranjeras de gran jerarquía intelectual, que han prestado servicios eminentes a la Educación o a la Cultura y cuya labor docente o artística es de indiscutible reconocimiento público. En 1997 recibe la Medalla “CRUZ DE BULLACA AL GRAN COMENDADOR” otorgado por el Gobierno de la República de Colombia, en reconocimiento a su incansable preocupación por el folklore latinoamericano. El año 2001 recibe el Premio a Lo Chileno, reconocimiento instituido por la Empresa IANSA; el Premio Chiloé de Extensión Cultural 2005, y la Distinción Pablo Neruda otorgada por el Consejo Nacional de la Cultura y las Artes en diciembre de 2005.

Margot Loyola actualmente es miembro honorario de la Asociación Argentina del folklore. Presidenta honoraria de UNAFO (Unión Nacional del Folklore), Directora honoraria de CEFOL (Centro de Estudios del Folklore) y Directora del Consejo latinoamericano de la danza tradicional.